V provozu recyklační linky cirkuluje každou hodinu zhruba 50 m3 vody, kterou se podrcené plasty promývají. Součástí linky na recyklaci plastů je proto také čistírna, kde se recykluje voda.

Kapacita linky na recyklaci plastových fólií v Němčicích nad Hanou je až 5000 tun zpracovaných plastů ročně. I přesto, že se obchodníci snaží zajistit co nejčistší vstupní materiál, nečistotám se nelze vyhnout.
Před samotnou recyklací je nutné fólie zbavit nečistot. Děje se tak v několika fázích. Spotřeba vody je poměrně vysoká, a proto byla pro provoz linky navržena samostatná fyzikálně-chemická čistírna odpadních vod. V první řadě se odstraní mechanické nečistoty. Těžká frakce (písek, hlína, kovy…) sedimentují na dně podzemních nádrží, na povrchu pak plave vrstva jemných plastových částic z drcení. Pro separaci těchto částic je voda z nádrží čerpána na parabolické síto. Předčištěná voda teče do dalších nádrží, kde dál sedimentují jemné nečistoty.
Odtud se část vody čerpá do reaktorů k chemickému dočištění, které zajistí vysrážení a vyvločkování zbylých nečistot, které s v podobě „vločky“ usadí na dně reaktoru. V horní části reaktoru zůstane vyčištěná voda. Tímto se koloběh uzavírá a voda se vrací zpátky do výrobního procesu. Jednou za tři týdny je linka odstavena, kompletně vyčištěna a systém je naplněn čistou vodou.
Nebude trvat dlouho a provoz recyklace plastů v Němčicích bude osazen solárními panely, čímž opět posílí svou soběstačnost a udržitelnost.